Protein–RNA interactions for Protein: P16546

Sptan1, Spectrin alpha chain, non-erythrocytic 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sptan1P16546 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Fcmr-201ENSMUST00000038829 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Klhdc9-201ENSMUST00000061878 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Sptan1P16546 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptan1P16546 Fstl3-201ENSMUST00000020575 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptan1P16546 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptan1P16546 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptan1P16546 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptan1P16546 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptan1P16546 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptan1P16546 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptan1P16546 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptan1P16546 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Sptan1P16546 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Sptan1P16546 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Cdkl3-206ENSMUST00000109079 2051 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Cdkl3-208ENSMUST00000109081 2063 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Sptan1P16546 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Cyp4f15-204ENSMUST00000168171 2168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Sptan1P16546 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms