Protein–RNA interactions for Protein: P15508

Sptb, Spectrin beta chain, erythrocytic, mousemouse

Predictions only

Length 2,128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptbP15508 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SptbP15508 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SptbP15508 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SptbP15508 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SptbP15508 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SptbP15508 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SptbP15508 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SptbP15508 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SptbP15508 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SptbP15508 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
SptbP15508 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
SptbP15508 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
SptbP15508 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms