Protein–RNA interactions for Protein: P15314

Irf1, Interferon regulatory factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irf1P15314 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Actl6b-205ENSMUST00000139395 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 AC154532.1-201ENSMUST00000227860 965 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Irf1P15314 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Irf1P15314 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms