Protein–RNA interactions for Protein: P13864

Dnmt1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,620 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt1P13864 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dnmt1P13864 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dnmt1P13864 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dnmt1P13864 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dnmt1P13864 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnmt1P13864 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnmt1P13864 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnmt1P13864 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dnmt1P13864 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dnmt1P13864 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Dnmt1P13864 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms