Protein–RNA interactions for Protein: P10855

Ccl3, C-C motif chemokine 3, mousemouse

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl3P10855 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Snhg10-202ENSMUST00000222812 527 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccl3P10855 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccl3P10855 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.7 ms