Protein–RNA interactions for Protein: P10404

MLV-related proviral Env polyprotein, mousemouse

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Length 641 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P10404 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
P10404 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Egln2-202ENSMUST00000108382 1756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
P10404 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
P10404 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
P10404 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
P10404 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
P10404 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
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