Protein–RNA interactions for Protein: P0C6B7

Igsf6, Immunoglobulin superfamily member 6, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igsf6P0C6B7 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Igsf6P0C6B7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Lgmn-202ENSMUST00000110020 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Igsf6P0C6B7 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms