Protein–RNA interactions for Protein: P08122

Col4a2, Collagen alpha-2(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,707 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a2P08122 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Col4a2P08122 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Col4a2P08122 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms