Protein–RNA interactions for Protein: P08046

Egr1, Early growth response protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Egr1P08046 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Egr1P08046 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Egr1P08046 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr1P08046 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Egr1P08046 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Gm15853-202ENSMUST00000195518 2041 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Egr1P08046 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms