Protein–RNA interactions for Protein: P01921

H2-Ab1, H-2 class II histocompatibility antigen, A-D beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 265 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Ab1P01921 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
H2-Ab1P01921 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
H2-Ab1P01921 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.4 ms