Protein–RNA interactions for Protein: P01910

H2-Aa, H-2 class II histocompatibility antigen, A-K alpha chain, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-AaP01910 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gabarap-201ENSMUST00000018711 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
H2-AaP01910 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.51■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
H2-AaP01910 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms