Protein–RNA interactions for Protein: P01648

Ig kappa chain V-V region HP 91A3, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01648 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
P01648 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
P01648 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01648 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01648 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
P01648 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01648 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01648 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01648 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01648 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
P01648 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01648 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01648 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01648 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01648 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
P01648 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
P01648 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01648 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01648 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01648 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01648 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01648 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01648 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
P01648 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01648 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01648 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
P01648 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01648 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01648 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01648 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01648 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01648 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01648 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
P01648 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
P01648 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms