Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01638 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01638 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
P01638 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
P01638 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01638 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01638 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01638 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01638 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01638 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01638 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01638 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01638 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01638 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01638 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01638 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
P01638 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01638 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01638 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01638 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01638 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01638 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
P01638 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01638 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
P01638 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.9 ms