Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01635 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01635 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
P01635 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
P01635 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
P01635 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
P01635 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
P01635 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01635 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01635 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01635 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01635 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01635 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01635 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01635 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01635 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
P01635 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
P01635 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01635 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01635 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01635 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01635 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01635 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01635 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
P01635 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01635 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01635 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
P01635 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms