Protein–RNA interactions for Protein: O89026

Robo1, Roundabout homolog 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,612 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Robo1O89026 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Robo1O89026 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo1O89026 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo1O89026 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo1O89026 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Robo1O89026 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo1O89026 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo1O89026 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo1O89026 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo1O89026 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo1O89026 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Robo1O89026 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms