Protein–RNA interactions for Protein: O88968

Tcn2, Transcobalamin-2, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcn2O88968 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Tuba3b-201ENSMUST00000087445 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Tcn2O88968 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Tcn2O88968 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.1 ms