Protein–RNA interactions for Protein: O88703

Hcn2, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 2, mousemouse

Predictions only

Length 863 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn2O88703 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Hcn2O88703 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Hcn2O88703 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms