Protein–RNA interactions for Protein: O88602

Cacng2, Voltage-dependent calcium channel gamma-2 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng2O88602 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Cacng2O88602 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Ppp3ca-201ENSMUST00000056758 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Gpr137-203ENSMUST00000099776 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Cacng2O88602 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms