Protein–RNA interactions for Protein: O88545

Cops6, COP9 signalosome complex subunit 6, mousemouse

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Length 324 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops6O88545 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Cops6O88545 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Cops6O88545 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops6O88545 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Cops6O88545 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
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