Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm3164-201ENSMUST00000168866 1945 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm8309-201ENSMUST00000206627 1448 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Dnmt3bO88509 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Dnmt3bO88509 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms