Protein–RNA interactions for Protein: O88271

Cfdp1, Craniofacial development protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 295 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfdp1O88271 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Cfdp1O88271 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Cfdp1O88271 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
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