Protein–RNA interactions for Protein: O70507

Hcn4, Potassium/sodium hyperpolarization-activated cyclic nucleotide-gated channel 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hcn4O70507 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 D11Wsu47e-202ENSMUST00000106621 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Tmem179-201ENSMUST00000066791 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Fbxo7-202ENSMUST00000117597 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Fbxo44-201ENSMUST00000057907 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Angptl6-201ENSMUST00000043726 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Hcn4O70507 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Hcn4O70507 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms