Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vamp4O70480 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vamp4O70480 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms