Protein–RNA interactions for Protein: O55135

Eif6, Eukaryotic translation initiation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 245 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Eif6O55135 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Eif6O55135 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Eif6O55135 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Eif6O55135 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Eif6O55135 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif6O55135 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
Eif6O55135 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms