Protein–RNA interactions for Protein: O55029

Copb2, Coatomer subunit beta', mousemouse

Predictions only

Length 905 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copb2O55029 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Copb2O55029 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Copb2O55029 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms