Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
BckdkO55028 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms