Protein–RNA interactions for Protein: O54890

Itgb3, Integrin beta-3, mousemouse

Predictions only

Length 787 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3O54890 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Itgb3O54890 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Itgb3O54890 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms