Protein–RNA interactions for Protein: O54786

Dffa, DNA fragmentation factor subunit alpha, mousemouse

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DffaO54786 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
DffaO54786 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DffaO54786 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DffaO54786 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DffaO54786 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DffaO54786 Stard3-201ENSMUST00000018311 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DffaO54786 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DffaO54786 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DffaO54786 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
DffaO54786 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DffaO54786 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
DffaO54786 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
DffaO54786 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DffaO54786 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DffaO54786 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DffaO54786 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DffaO54786 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DffaO54786 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DffaO54786 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DffaO54786 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DffaO54786 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DffaO54786 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
DffaO54786 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DffaO54786 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
DffaO54786 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DffaO54786 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DffaO54786 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DffaO54786 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DffaO54786 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DffaO54786 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DffaO54786 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
DffaO54786 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DffaO54786 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
DffaO54786 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DffaO54786 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DffaO54786 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
DffaO54786 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DffaO54786 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DffaO54786 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
DffaO54786 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DffaO54786 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DffaO54786 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DffaO54786 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
DffaO54786 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
DffaO54786 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
DffaO54786 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
DffaO54786 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
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