Protein–RNA interactions for Protein: O54781

Srpk2, SRSF protein kinase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 681 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srpk2O54781 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Srpk2O54781 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Mboat1-201ENSMUST00000047311 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Srpk2O54781 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Srpk2O54781 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Srpk2O54781 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srpk2O54781 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srpk2O54781 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srpk2O54781 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srpk2O54781 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Srpk2O54781 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms