Protein–RNA interactions for Protein: O35474

Edil3, EGF-like repeat and discoidin I-like domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Edil3O35474 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Edil3O35474 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edil3O35474 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edil3O35474 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edil3O35474 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edil3O35474 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edil3O35474 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edil3O35474 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edil3O35474 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edil3O35474 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Edil3O35474 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms