Protein–RNA interactions for Protein: O35457

Ccrl2, C-C chemokine receptor-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccrl2O35457 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Fam172a-202ENSMUST00000099358 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Ccrl2O35457 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Ccrl2O35457 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms