Protein–RNA interactions for Protein: O35452

Tnxb, Tenascin X, mousemouse

Predictions only

Length 4,006 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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TnxbO35452 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.78□□□□□ -0.36
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TnxbO35452 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TnxbO35452 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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TnxbO35452 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
TnxbO35452 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
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