Protein–RNA interactions for Protein: O35424

H2-Ob, Histocompatibility 2, O region beta locus, mousemouse

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-ObO35424 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-ObO35424 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-ObO35424 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-ObO35424 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-ObO35424 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-ObO35424 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-ObO35424 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
H2-ObO35424 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
H2-ObO35424 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms