Protein–RNA interactions for Protein: O35392

Foxd2, Forkhead box protein D2, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Foxd2O35392 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Nlrp5-ps-201ENSMUST00000044683 1913 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Foxd2O35392 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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Foxd2O35392 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Foxd2O35392 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms