Protein–RNA interactions for Protein: O35379

Abcc1, Multidrug resistance-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc1O35379 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Abcc1O35379 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Gm26517-201ENSMUST00000181279 1172 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
Abcc1O35379 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms