Protein–RNA interactions for Protein: O35350

Capn1, Calpain-1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 713 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capn1O35350 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 BC017158-201ENSMUST00000033044 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 B3gat2-202ENSMUST00000140583 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Capn1O35350 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Capn1O35350 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.3 ms