Protein–RNA interactions for Protein: O35228

Ebi3, Interleukin-27 subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ebi3O35228 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Ebi3O35228 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms