Protein–RNA interactions for Protein: O35216

Cenpa, Histone H3-like centromeric protein A, mousemouse

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CenpaO35216 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Mfsd10-201ENSMUST00000001109 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
CenpaO35216 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms