Protein–RNA interactions for Protein: O35182

Smad6, Mothers against decapentaplegic homolog 6, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smad6O35182 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad6O35182 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Smad6O35182 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smad6O35182 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.5 ms