Protein–RNA interactions for Protein: O35173

Kcns1, Potassium voltage-gated channel subfamily S member 1, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcns1O35173 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Kcns1O35173 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms