Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Polr1aO35134 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Prmt6-201ENSMUST00000106567 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Polr1aO35134 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Polr1aO35134 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms