Protein–RNA interactions for Protein: O35085

Arx, Homeobox protein ARX, mousemouse

Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArxO35085 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Spc24-205ENSMUST00000217382 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ArxO35085 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ArxO35085 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArxO35085 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArxO35085 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArxO35085 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArxO35085 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArxO35085 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
ArxO35085 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArxO35085 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArxO35085 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArxO35085 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArxO35085 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArxO35085 Lin7a-203ENSMUST00000218031 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ArxO35085 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ArxO35085 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ArxO35085 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArxO35085 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArxO35085 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArxO35085 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArxO35085 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArxO35085 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArxO35085 Fev-201ENSMUST00000068631 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ArxO35085 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArxO35085 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArxO35085 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArxO35085 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArxO35085 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArxO35085 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ArxO35085 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Gm13657-201ENSMUST00000135682 1939 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ArxO35085 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms