Protein–RNA interactions for Protein: O35074

Ptgis, Prostacyclin synthase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtgisO35074 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
PtgisO35074 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
PtgisO35074 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgisO35074 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
PtgisO35074 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms