Protein–RNA interactions for Protein: O09044

Snap23, Synaptosomal-associated protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap23O09044 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snap23O09044 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Snap23O09044 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Snap23O09044 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Snap23O09044 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms