Protein–RNA interactions for Protein: O08601

Mttp, Microsomal triglyceride transfer protein large subunit, mousemouse

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Length 894 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MttpO08601 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Pgrmc2-201ENSMUST00000058578 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
MttpO08601 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Pick1-201ENSMUST00000018295 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
MttpO08601 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
MttpO08601 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC17.96■□□□□ 0.46
MttpO08601 Hes3-201ENSMUST00000094438 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
MttpO08601 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MttpO08601 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MttpO08601 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
MttpO08601 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MttpO08601 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MttpO08601 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MttpO08601 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MttpO08601 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MttpO08601 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MttpO08601 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
MttpO08601 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
MttpO08601 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms