Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Gm2056J3QQ02 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Gm15558-201ENSMUST00000126849 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Gm2056J3QQ02 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms