Protein–RNA interactions for Protein: J3QPC3

BC024978, cDNA sequence BC024978, mousemouse

Predictions only

Length 361 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC024978J3QPC3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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BC024978J3QPC3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
BC024978J3QPC3 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC024978J3QPC3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC024978J3QPC3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC024978J3QPC3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
BC024978J3QPC3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC024978J3QPC3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC024978J3QPC3 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC024978J3QPC3 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
BC024978J3QPC3 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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BC024978J3QPC3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
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BC024978J3QPC3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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