Protein–RNA interactions for Protein: J3QNX5

Shisa8, Cysteine-knot AMPAR-modulating protein 39, mousemouse

Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa8J3QNX5 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Shisa8J3QNX5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Shisa8J3QNX5 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms