Protein–RNA interactions for Protein: J3QME6

Lipo1, Lipase, mousemouse

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lipo1J3QME6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Lipo1J3QME6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
Lipo1J3QME6 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms