Protein–RNA interactions for Protein: H7BX60

Pot1b, Protection of telomeres 1B, mousemouse

Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pot1bH7BX60 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
Pot1bH7BX60 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pot1bH7BX60 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms